La APC tiene dos órganos de toma de decisión y de gobierno:

•   La Asamblea General es el órgano supremo de gobierno de la Asociación y está integrada por todas las personas asociadas. Se reúne, ordinariamente, una vez al año en sesión virtual.

•   La Junta Directiva es el órgano que gestiona y representa a la Asociación. Está formado por una Presidencia, una Vicepresidencia, una Secretaría, una Tesorería y, al menos, 3 Vocales. Se reúne un mínimo de tres veces al año o cuantas veces lo determine su Presidencia.

El funcionamiento de la Asociación se hace a través de su propia WEB utilizando la tecnología de comunicación y redes de Internet.

Cada socio tiene su propia dirección de correo, dentro del dominio @cooperantes.net, y se comunica formal o informalmente con otros socios a través del correo electrónico y de los foros privados que la APC pone a su disposición.

Las reuniones de la Junta Directiva o las Asambleas Generales de socios se realizan de forma virtual en los foros abiertos para estos fines por la APC.